Das Ziel der Organisation ist letztendlich die Weltherrschaft. Diese versuchen sie zu erreichen, indem sie die Bijū einfangen und sie mittels Fūinjutsu: Genryū Kyū Fūjin aus ihrem Jinchūriki extrahieren. Dadurch stirbt der Jinchūriki, das Bijū respektive das überdurchschnittlich starke Chakra wird während dem Extraktionsprozess in einer Statue versiegelt.
Hintergründe:
Da es keine Kriege in der letzten Zeit gegeben hatte, können es sich die Ninjadörfer nicht leisten, so wenig Geld zu verlangen. Daher heuern die kleineren Dörfer Akatsuki statt teure Ninjadörfern an. Durch die Bijū kann Akatsuki jederzeit Kriege beginnen und sofort wieder beenden, um dadurch ihren guten Ruf noch zu verstärken und jedes Land von ihnen abhängig zu machen. Da die Ninjadörfer nun keine Arbeit mehr hätten, würden sie an mangelndem Kapital zugrunde gehen.
Da Akatsuki nun die einzige größere Ninja-Macht wäre, könnten sie ohne Probleme die anderen Reiche erobern. Obwohl dieser Plan so weitreichend und schwerwiegend ist, wissen nicht alle Mitglieder beim Eintritt in die Organisation davon; Hidan zum Beispiel wurde es erst erzählt, nachdem er einige Zeit Mitglied war. Ob dies die wahren Absichten der Organisation sind, ist nicht bekannt. Es ist allerdings naheliegend, dass sie mit Hilfe dieses Chakras, aus dem eine sehr große Kampfkraft resultiert und der damit zusammenhängenden Zerstörungskraft, versuchen würden, die Menschheit zu unterwerfen.
Die wahren Absichten :
Die Anführer Akatsukis, Pain bzw. Nagato sowie Madara, verfolgen jedoch beide unterschiedliche Prozesse, die im Endeffekt zu ein und demselben Ziel führen: Beide sind auf der Suche nach Gerechtigkeit. Nagato will diese mit Hilfe einer Waffe umsetzen, die aus dem Chakra aller neun Bijū hergestellt wird.
Dadurch erstrebt er, im Gegensatz zu Madara, nicht die Alleinherrschaft über die Menschheit sondern lediglich Frieden auf Erden. Madara hat ähnliche Absichten, will sich die Menschheit aber mittels Mugen Tsukuyomi untertan machen, um so Frieden zu produzieren.
Quelle: Narutopedia